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學術動態

鄧明華:基于深度學習的單細胞聚類與標注
2021年11月29日 | 點擊次數:

報告承辦單位:長沙理工大學數學與統計學院

報告題目:基于深度學習的單細胞聚類與標注 

報告內容:本報告將匯報本課題組近期在單細胞RNA-Seq數據分析上的兩個工作ScziDesk和ScSemiCluster. 單細胞RNA-Seq技術現在成為了生物學研究的基本手段,但其高噪聲和稀疏性為數據分析帶來了挑戰。細胞聚類和細胞標注是單細胞測序數據分析的最基本任務,我們融合聚類和基于深度學習的非線性降維方法,開發了聚類方法scziDesk; 進一步結合領域適應(Domain Adaptation)方法,開發了細胞標注方法scSemiCluster, 模擬數據和實際數據分析表明了算法的有效性。 

報告人姓名:  鄧明華

報告人所在單位:北京大學數學科學學院

報告人職稱/職務及學術頭銜: 教授博士生導師

報告時間: 20211129日周一上午10:00-11:00

報告地點: 通訊會議ID:236-235-120

報告人簡介:鄧明華,男,北京大學數學科學學院教授。1987年9月-1998年1月在北京大學數學學院學習,畢業后留校工作至今。2003年8月晉升為副教授,2006年任博士生導師,2009年8月晉升為教授。其間2001年2月-2003年8月在美國南加州大學計算分子生物學中心從事博士后研究工作,2009年8月-2010年1月美國耶魯大學訪問副教授。鄧明華從事生物信息學研究,發表SCI論文80余篇。曾先后主持5項自然科學基金面上項目和1項863項目,參加3項973項目和1項科技部重點研發項目。

 

 

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